Родился в Суражском районе, Витебской области, Белорусской ССР, СССР. В 1959 году окончил ВГИК (мастерская М.И. Ромма и В.В. Белокурова). Ещё в период учёбы он женился на своей сокурснице Инге Будкевич. В 1960 году у них родилась дочь Вероника, которая впоследствии пошла по стопам родителей, став актрисой. В кино Эдуард Изотов дебютировал в 1959 году главной ролью в мелодраме «В степной тиши». Зрителям актёр запомнился и полюбился по роли Ивана в фильме-сказке Александра Роу «Морозко», вышедшей на экраны в 1964 году. В 1959-1984 - актер Театра-студии киноактера. Дублировал и озвучивал фильмы. Заслуженный артист РФ (1999). Ушёл из жизни в Москве. Похоронен актёр на Химкинском кладбище.